中文Нова варијанта коронавируса сој 501И-В2 из Јужне Африке
Јужна Африка је 18. децембра 2020. открила мутанта 501И-В2 новог коронавируса.Сада се јужноафрички мутант проширио у више од 20 земаља.Експерименти су показали да горе наведени мутанти новог корона вируса могу да носе друге нове варијанте новог коронавируса мутација К417Н/Т, Е484К и Н501И које могу смањити способност неутрализације антитела за неутрализацију плазме изазване вакцином.Међутим, у поређењу са референтним геномом Вух01 (број секвенце МН908947), секвенца јужноафричког мутантног генома 501И.В2 има 23 варијанте нуклеотида.Има исту мутацију Н501И као подтип британског мутанта Б.1.1.7, али и даље садржи мутације на два кључна места Е484К и К417Н С протеина које имају потенцијално важне ефекте на способност вируса да инфицира.
Нови коронавирус је једноланчани РНК вирус, чије су мутације генома чешће.Детекција једне мете може лако довести до пропуштеног откривања узорака са ниским вирусним оптерећењем и мутираним сојевима вируса.Стопа поновног прегледа код појединачне позитивне у детекцији мете, може достићи више од 10%, што може повећати оптерећење и продужити време дијагнозе.Детекција више мета и међусобна верификација резултата сваке мете могу повећати стопу откривања и олакшати рану дијагнозу.
Слика 1. Шематски дијаграм механизма инфекције новим корона вирусом
Нови мутант корона вируса Б.1.1.7 из Британије
26. децембра 2020. године објављен је први научни рад о соју Б.1.1.7.Институт за хигијену Универзитета у Лондону, Велика Британија и тропске болести, потврдио је да је сој Б.1.1.7 способнији за ширење од других сојева, што је било више од 56% (95% ЦИ 50-74%).Пошто овај нови мутантни сој има очигледнију моћ преноса, постало је теже контролисати ЦОВИД-19.Следећег дана, Универзитет у Бирмингему у Уједињеном Краљевству је поставио чланак на МедРкив.Студија је открила да је број копија гена ОРФ1аб и Н вируса код пацијената инфицираних мутантним сојем Б.1.1.7 (отпадање С-гена) значајно повећан;ова појава је праћена у популацији.У овом чланку се истиче да пацијенти заражени мутантом Б.1.1.7 из Британије имају значајно веће вирусно оптерећење, тако да овај мутант може бити и патогенији.
Слика 2. Секвенца мутације генома садржана у мутантном соју корона вируса Б.1.1.7 из Британије
Слика 3. Мутација Н501И се догодила и у Британији и у Јужној АфрициВарианте
Комплет за откривање нових варијанти коронавируса
Цхуангкун Биотецх Инц. је успешно развио комплет за откривање нових варијанти коронавируса Б.1.1.7 и 501И-В2.
Предности овог производа: висока осетљивост, симултана детекција 4 мете, покривајући главна места мутација мутантног соја Б.1.1.7 и јужноафричког мутантног соја 501И.В2.Овај комплет може истовремено да открије места мутације Н501И, ХВ69-70дел, Е484К и нови ген коронавируса С;Брз тест: потребно је само 1 сат и 30 минута од узимања узорка до резултата.
Слика 4. Детекција криве амплификације варијанте ЦОВИД-19 у Британији
Слика 5. Детекција криве амплификације јужноафричке варијанте ЦОВИД-19
Слика 6. Дивљи тип криве амплификације новог коронавируса
Није јасно како ове мутације акумулирају нови дугорочни утицај пандемије ЦОВИД-19.Али ово нас подсећа да ове мутације могу утицати на ефикасност природног имунитета и имунитета изазваног вакцинацијом.Такође нас подсећа да морамо да континуирано пратимо нови коронавирус дуго времена и ажурирамо вакцину против ЦОВИД-19 како бисмо се суочили са еволуцијом новог коронавируса.
Време поста: 12.03.2021